Eilisen väitöskirjan (Akula Murali)
ruotsalainen yhteenveto löytyi väitöskirjan sivuilta ja teen
siitä suomennosta: http://hdl.handle.net/2077/57427
”Geranylgeranylaasientsyymi
(GGT-1) kytkee noin sataan solun sisällä olevaan
proteiiniin isoprenoidin, rasvamolekyylin, joka täten
prenyloi proteiinin.
Eräs prenyloituvien
proteiinien luokka on RHO-proteiinit. RHO-proteiinit ovat
infektioissa ja vaurioissa aktivoituvien tulehdussolujen funktiolle
tärkeitä. On oltu kauan sitä mieltä, että RHO-proteiinit
pystyvät kiinnittymään prenyloituina helpommin solukalvoon,
jossa ne pääsevät kontaktiin RHO-proteiinien
aktivaattoriproteiinien kanssa. Kun ensi kertaa alettiin tätä
tutkia, havaittiin odotetusti hiiren makrofagien GGT-1
-poistogeenisyyden estävän RHO-proteiinien modifioitumisen ,
mutta odottamatonta löytöä oli, että
inaktivoitumisen sijasta RHO-proteiinit koostuivat kokoon
aktiivissa muodossaan ja makrofageista tuli hyperaktiivisia ja ne
aiheuttivat tulehdusta ja nivelreumaa.
Tutkijoita
kiinnosti myös, miten
statiinit pystyvät
aktivoimaan RHO-proteiineja ja stimuloimaan esiin tulehduksellisten
ainesten tuotantoa. Kun statiinit
estävät kolesterolin syntetisoitumista, estyy myös kyseessä
olevien RHO-proteiinien prenylaatioon tarvittavien prenyloivien
lipidimolekyylien
(isoprenoidien) tuotanto. Tämä väitöstyö keskittyy tutkimaan
näitä ongelmia.
Ensimmäisessä
osatyössä tutkijaryhmä havaitsi, että GGT-1-puutteisissa
makrofageissa aktivoitui pyriini-inflammasomi (MEFV) ja kaspaasi-1,
mitkä johtivat inflammaatiota käynnistävien ainesten kuten
IL-1b tuotantoon. Toisessa osatyössä tutkijat havaitsivat, että
hiirillä RAC1 yksinään vastasi tulehduksen ja reumatismin
kehkeytymisestä. Lisäksi tutkijat havaitsivat, että jos RAC1 jää
prenyloitumatta, se muuttuu hyperaktiiviseksi, sillä se saa vahvasti
lisääntyneen kyvyn sitoutua RAS-GTPaasia aktivoivan proteiinin(GAP)
kaltaiseen proteiiniin 1 (IQGAP1) ja TIAM 1 (GEF).
TIAM1 ja IQGAP1-
proteiinit antavat stimulaatiota NF-kB-proteiinille,
inflammasomille ja kaspaasi-1:lle.
Osoitettaessa RAC1:n
ja IQGAP1:n osallistumiset tehtiin ensin RAC1- poistogeenisyys ja
havaittiin reumatismin käytännöllisesti katsoen kadonneen. Kun
sitten tehtiin IQGAP1-poistogeenisyys, havaittiin RAC1-proteiinin
ja muiden RHO-proteiinien saaneen takaisin normaaliaktiivisuutensa
sekä tulehduksen ja reumatismin parantuneen.
Tutkijat huomasivat
myös, että statiinit estävät RAC1-proteiinin prenyloitumista ja
lisäävät IL-1b-tuotantoa ja tämä vaikutus riippuu IQGAP1:stä
Näistä
tutkimuksista voidaan tehdä johtopäätös, että prenylaation
estyttyä RAC1 sitoutuu IQGAP1- ja TIAM1- proteiineihin, muuttuu
hyperaktiiviksi ja aiheuttaa massiivin tulehduksen. Tämä
puolestaan merkitsee sitä, että prenyloituminen normaalisti
toimiessaan jarruttaa immuunivastetta estämällä RAC1-proteiinin
aktivoitumista.
Laajemmin asiaa
katsoen nämä tulokset jo sinänsä johtavat prenylaation
lisääntyneeseen ymmärtämiseen , mutta lisäksi tunnistettiin
IQGAP1 ja jossain määrin myös RAC1 uusina mahdollisina
lääkekohteina, joita voidaan käyttää epätavallisen ja
vakavan autoinflammtorisen taudin, mevalonikinaasin puutteen,
hoitoon.
-
Sitat" Sammanfattning
-
Enzymet geranylgeranyltransferase typ I (GGTase-1) kopplar på en fettmolekyl på ett 100-tal proteiner inne i celler i en process som kallas prenylering.
-
En klass proteiner som prenyleras heter RHO-proteiner. RHO-proteiner är viktiga för funktionen hos inflammatoriska celler som aktiveras vid infektioner och skador. Man har länge tänkt att prenyleringen gör att RHO-proteinerna lättare kan binda till membran i cellen där de kommer i kontakt med proteiner som aktiverar RHO-proteinerna. När vi först studerade detta fann vi att om man knockar ut genen som kodar för GGTase-1 i makrofager hos möss så hindras modifieringen av RHO-proteiner, som förväntat, men istället för att inaktiveras så ansamlade sig RHO-proteinerna i sin aktiva form, och makrofagerna blev hyperaktiva och orsakade inflammation och ledgångsreumatism.
-
Vi är också intresserade av hur de kolesterolsänkande statinerna kan aktivera RHO-proteiner och stimulera produktion av inflammatoriska substanser. När statinerna hämmar kolesterolsyntesen så hämmas också produktionen av den fettmolekyl (isoprenoid) som kopplas på RHO-proteinerna. I denna avhandling har jag försökt svara på dessa frågor.
-
I det första projektet, fann vi att i makrofager som saknar GGTase-1 aktiverar pyrin-inflammasomen och caspas-1 som leder till produktionen av en inflammationsdrivande susbtans som heter interleukin 1-beta (IL-1b).
-
I det andra projektet fann vi att RHO-proteinet RAC1 ensamt ansvarar för utvecklingen av inflammation och reumatism i mössen.
-
Vi fann vidare att när RAC1 inte prenyleras, så blir det hyperaktivt på grund av att det får en kraftigt ökad förmåga att binda till proteinerna TIAM1 och IQGAP1 vilka stimulerar signalering till proteinerna NF-KB och som tidigare, till inflammasomen och caspas-1.
-
För att bevisa inblandingen av RAC1 och IQGAP1 så knockade vi först ut genen för RAC1 och fann att inflammationen och reumatismen så gott som försvann, och när vi knockade ut genen för IQGAP1 fann vi att RAC1 (och övriga RHO-proteiner) återfick normalaktivitet och att inflammationen och reumatismen botades.
-
Vi fann också att att statiner hämmar prenylering av RAC1 och ökar produktionen av IL-1b och att denna effekt beror på IQGAP1.
-
Från dessa studier kan vi dra slutsatsen att när prenylering hämmas, så binder RAC1 till IQGAP1 och TIAM1, blir hyperaktivt och orsakar sen massiv inflammation.
-
Detta betyder i sin tur att prenylering normalt sett fungerar som en broms för immunförsvaret genom att hämma RAC1-aktivering.
- I ett bredare perspektiv leder våra resultat till en ökad förståelse för prenylering i sig, men vi identifierar också IQGAP1, och till viss mån även RAC1, som nya potentiella måltavlor för läkemedel som kan användas för behandling av en ovanlig men allvarlig autoinflammatorisk sjukdom som heter Mevalone kinase deficiency (MKD) ."
GGTase-1,
Geranylgeranyltransferase type 1
RAC1, Ras-related C3
botulinum toxin substrate 1
RHO, Ras homolog
gene family
IQGAP1, Ras
GTPase-activating-like protein IQGAP1 (GAP- lik)
TIAM1, T-cell
lymphoma invasion and metastasis- inducing protein 1 ( GEF)
MKD, Mevalonate
kinase deficiency
Muistiin 15.12. 2018
etsin näistä kahdesta geenistä lähdetietoa
TIAM1 gene (21q22.11), encodes GEF , (Guanine nucleotide exchange
factor)
- TIAM1 gene
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/7074
This gene encodes a RAC1-specific guanine nucleotide exchange factor (GEF). GEFs mediate the exchange of guanosine diphosphate (GDP) for guanosine triphosphate (GTP). The binding of GTP induces a conformational change in RAC1 that allows downstream effectors to bind and transduce a signal. This gene thus regulates RAC1 signaling pathways that affect cell shape, migration, adhesion, growth, survival, and polarity, as well as influencing actin cytoskeletal formation, endocytosis, and membrane trafficking. This gene thus plays an important role in cell invasion, metastasis, and carcinogenesis. In addition to RAC1, the encoded protein activates additional Rho-like GTPases such as CDC42, RAC2, RAC3 and RHOA. This gene encodes multiple protein isoforms that experience a diverse array of intramolecular, protein-protein, and phosphorylation interactions as well as phosphoinositide binding. Both the longer and shorter isoforms have C-terminal Dbl homology (DH) and pleckstrin homology (PH) domains while only the longer isoforms of this gene have the N-terminal myristoylation site and the downstream N-terminal PH domain, ras-binding domain (RBD), and PSD-95/DlgA/ZO-1 (PDZ) domain. [provided by RefSeq, Jul 2017]
This gene encodes a RAC1-specific guanine nucleotide exchange factor (GEF). GEFs mediate the exchange of guanosine diphosphate (GDP) for guanosine triphosphate (GTP). The binding of GTP induces a conformational change in RAC1 that allows downstream effectors to bind and transduce a signal. This gene thus regulates RAC1 signaling pathways that affect cell shape, migration, adhesion, growth, survival, and polarity, as well as influencing actin cytoskeletal formation, endocytosis, and membrane trafficking. This gene thus plays an important role in cell invasion, metastasis, and carcinogenesis. In addition to RAC1, the encoded protein activates additional Rho-like GTPases such as CDC42, RAC2, RAC3 and RHOA. This gene encodes multiple protein isoforms that experience a diverse array of intramolecular, protein-protein, and phosphorylation interactions as well as phosphoinositide binding. Both the longer and shorter isoforms have C-terminal Dbl homology (DH) and pleckstrin homology (PH) domains while only the longer isoforms of this gene have the N-terminal myristoylation site and the downstream N-terminal PH domain, ras-binding domain (RBD), and PSD-95/DlgA/ZO-1 (PDZ) domain. [provided by RefSeq, Jul 2017]
- summary
-
smart00325
Location:77 → 266 - RhoGEF; (GEF) Guanine nucleotide exchange factor for Rho/Rac/Cdc42-like GTPases
-
cd01255
Location:268 → 439 - PH2_Tiam1_2; T-lymphoma invasion and metastasis 1 and 2 Pleckstrin Homology (PH) domain, C-terminal domain
Related articles in PubMed
- Competition between TIAM1 and Membranes Balances Endophilin A3 Activity in Cancer Metastasis. Poudel KR, et al. Dev Cell, 2018 Jun 18. PMID 29920278,
- The Tiam1 guanine nucleotide exchange factor is auto-inhibited by its pleckstrin homology coiled-coil extension domain. Xu Z, et al. J Biol Chem, 2017 Oct 27. PMID 28882897, Free PMC Article
- Expression of T-lymphoma invasion and metastasis factor on the occurrence of oral squamous cell carcinoma. Song B, et al. J Biol Regul Homeost Agents, 2017 Apr-Jun. PMID 28685528
- TIAM1 variants improve clinical outcome in neuroblastoma. Sanmartín E, et al. Oncotarget, 2017 Jul 11. PMID 28423360, Free PMC Article
- Computational Design of the Tiam1 PDZ Domain and Its Ligand Binding. Mignon D, et al. J Chem Theory Comput, 2017 May 9. PMID 28394603
- IQGAP1
- Domains (6) summary
-
smart00015
Location:774 → 796 - IQ; Calmodulin-binding motif
-
cd05133
Location:1003 → 1382 - RasGAP_IQGAP1; Ras-GTPase Activating Domain of IQ motif containing GTPase activating protein 1
-
smart00323
Location:992 → 1344 - RasGAP; GTPase-activator protein for Ras-like GTPases
-
cd00014
Location:45 → 159 - CH; Calponin homology domain; actin-binding domain which may be present as a single copy or in tandem repeats (which increases binding affinity). The CH domain is found in cytoskeletal and signal transduction proteins, including actin-binding proteins like ...
-
cd00201
Location:685 → 710 - WW; Two conserved tryptophans domain; also known as the WWP or rsp5 domain; around 40 amino acids; functions as an interaction module in a diverse set of signalling proteins; binds specific proline-rich sequences but at low affinities compared to other ...
-
pfam03836
Location:1452 → 1580 - RasGAP_C; RasGAP C-terminus
Related articles
-
Ras
GTPase-Activating-Like Protein IQGAP1 (IQGAP1) Promotes Breast
Cancer Proliferation and Invasion and Correlates with Poor Clinical
Outcomes. Zeng F, et al. Med Sci Monit, 2018 May 20.
PMID 29779034, Free
PMC Article
-
SUMOylation
of IQGAP1 promotes the development of colorectal cancer. Liang
Z, et al. Cancer Lett, 2017 Dec 28. PMID 28987385
-
The Scaffolding Protein IQGAP1 Interacts with NLRC3 and Inhibits Type I IFN Production. Tocker AM, et al. J Immunol, 2017 Oct 15. PMID 28864474, Free PMC Article
-
IQGAP1 silencing suppresses the malignant characteristics of laryngeal squamous cell carcinoma cells. Wang X, et al. Int J Biol Markers, 2018 Jan. PMID 28708206
-
IQ-domain GTPase-activating protein 1 promotes the malignant phenotype of invasive ductal breast carcinoma via canonical Wnt pathway. Zhao HY, et al. Tumour Biol, 2017 Jun. PMID 28618949
Inga kommentarer:
Skicka en kommentar